1909年 安图、抚松两县成立，隶属奉天省长白府。

1939年12月，安图县划归伪满洲帝国间岛省管辖。

1950年中华人民共和国公安部设置了长白山森林公安队。

1953年至1954年，林业部森调大队，对长白山森林资源进行了调查和区划，编制了长白山森林经历施业案，绘制了林相图，并将森林公安队改为森林警察队。

1955年至1957年，建立了头道森林经营所、二道、白山、黄松浦林场。

1958年，吉林省气象局、吉林省体育运动委员会，先后在天文峰东侧和温泉下3公里处建立高山气象站、高山冰雪场。

1960年4月，吉林省人民委员会根据全国人大一届三次会议提案和中华人民共和国林业部（工959）林经川字第54号指示精神，建立了“吉林省长白山自然保护区”。

 1960年，吉林省林业勘查设计院二队，为建立长白山自然保护区再次进行了调查和区划。

1962年12月，吉林省人民委员会批转林业厅的报告，对保护区的部分区划作了调整。

1968年12月，长白山自然保护区管理局被撤销，各管理站分别被下放给安图、长白、抚松县。

1972年12月，吉林省革委会收回了长白山自然保护区管理局，由吉林省林业局直接领导。

1982年8月，吉林省人民政府决定取消绝对保护区和一般保护区之别，统称“吉林省长白山自然保护区”，并重新调整了保护区范围，确定保护区面积为190582hm²（经1993年调查求积核实，准确面积为196465hm²）。

1986年7月，中华人民共和国林业部经过考证、审定，报请国务院批准，长白山自然保护区被列为国家级森林和野生动物类型自然保护区。

1988年11月9日，吉林省人大七届六次常委会通过了《吉林长白山国家级自然保护区管理条例》，使保护区的规范化管理有了法律上的依据。

2005年，吉林省委为加大对长白山自然保护区的保护力度，加快培育吉林省旅游优势产业，理顺各方面关系，实现对长白山的统一规划、统一保护、统一开发、统一管理，经2005年第7次省委会议讨论同意，成立长白山管委会。

长白山管委会级别为副厅级（吉林省人民政府文件【2005】19号文件）《吉林省人民政府关于进一步明确长白山保护开发区管理委员会管理体制和职能权限的意见》（吉林省人民政府文件【2006】30号文件）一文中又将其升格为正厅级，省林业厅将长白山保护局整建制委托长白山管委会管理。